De salarisadministratie is gebaseerd op de cao en de geldende arbeidsvoorwaarden binnen de organisatie. Afspraken over salaris, uren en vergoedingen worden daarin vastgelegd en vormen de basis voor de verwerking.
De arbeidsovereenkomst is in de praktijk meestal een afgeleide hiervan. Deze wordt opgesteld op basis van wat al in HR- en salarissystemen is ingericht en is daarmee niet de primaire bron voor de salarisverwerking.
Toch gaat het hier regelmatig mis. Niet omdat afspraken ontbreken, maar omdat wijzigingen niet overal consistent worden doorgevoerd.